El 12 de abril de 1987, autoridades del Museo y de la Facultad de Ciencias Naturales y Museo de la Universidad Nacional de La Plata se reunieron, junto con un grupo representativo de la comunidad de esta ciudad, con el propósito de crear un organismo no gubernamental que pudiera constituir una herramienta útil para la obtención de recursos destinados al Museo y su ágil manejo administrativo.
La Fundación Museo de La Plata adoptó el nombre de su ilustre fundador, Francisco Pascasio Moreno, obteniendo su personería jurídica el 17 de noviembre de 1987.
El nacimiento de la Fundación recibió un apoyo entusiasta y significativo por parte de la comunidad, certificado por la nómina de cerca de doscientos miembros fundadores, entre instituciones, personas y empresas representativas de todos los sectores.
El primer Comité Ejecutivo
En el Acta Constitutiva de sus Estatutos (2 de abril de 1987) se consigna que, por votación de sus miembros fundadores, quedó así constituido su primer Comité Ejecutivo:
Presidente: Conrado Ernesto Bauer
Vicepresidente 1º: Jorge Gazzaneo
Vicepresidente 2º: Mario Egidio Teruggi
Secretaria: María Alejandra Hendreich
Prosecretario: Roberto Tambornino
Tesorero: Juan María Manganiello
Protesorero: Héctor Recciniello
Vocales: Beatriz Hernández y Pedro Elbaum
Comisión de Fiscalización: Miguel Ángel García Lombardi, Julio Pajares y Aquiles Ortale.
Presidentes (desde 1987 a la fecha)
Conrado Bauer (desde el 02-04-1987 hasta el 04-09-1995)
Hugo M. Filiberto (desde el 04-09-1995 hasta el 05-10-2007)
Héctor Luis Fasano (desde el 05-10-2007 hasta su fallecimiento en mayo de 2009)
Pedro Elbaum (desde el 11-09-2009 hasta el 17-11-2021)
Luis Mansur (desde el 17-11-2021 hasta la actualidad)
Presidentes Honorarios:
Hugo Relva y Miguel Ángel García Lombardi